GLOSSAIRE

ADICAP

Association pour le Développement de l’informatique en cytologie et en anatomie pathologique

CCAM

Classification Commune des Actes médicaux

CIM10 / CIM11

Classification Internationale des Maladies

CISP2

Classification Internationale des Soins Primaires

CPT

Current Procedural Terminology : description des services médicaux, chirurgicaux et de diagnostic

FINESS

Immatriculation des établissements et entités juridiques porteurs d'une autorisation ou d'un agrément

ICD

International Classification of Diseases : nomenclature systématisée des termes cliniques

LOINC

Logical Observation Identifiers Names and Codes : terminologie de référence internationale pour le codage des observations et des documents électroniques (biologie médicale)

OMOP

OMOP Common Data Model (CDM) permet l'analyse systématique de plusieurs bases de données disparates en transformant les données des différentes bases en un format et une représentation communs puis en les analysant selon des modèles pré-renseignés (terminologie, vocabulaire, codage)

RRPS

Répertoire Partagé des Professionnels intervenant dans le système de Santé

Set OSIRIS

Jeu de données minimales pour le partage de données clinico-biologiques en cancérologie

SNOMED CT

Systematized Nomenclature of Medicine : Système international de terminologie clinique

SNOMED V3.5 VF

Traduction française de la SNOMED, des mises à jour ont été effectuées depuis 1998 indépendamment des évolutions et mises à jour de la SNOMED CT (propriétaire ASIP Santé)

AAP

Appels à projets

ABOS

Atlas Biologique de l'Obésité Sévère : biobanque dédiée à la recherche sur l'obésité et le diabète

ANR

Agence Nationale de la Recherche : mission de mettre en œuvre le financement de la recherche sur projets en France

API

Interface de Programmation Applicative : ensemble normalisé de classes, méthodes et fonctions gérés par une bibliothèque logicielle ou un service web

ASIP Santé

Agence Française de la Santé Numérique

BNDMR

Banque Nationale de Données Maladies Rares

CAD

Collecteur Analyseur de Données

CAQES

Contrat d'Amélioration de la Qualité et de l'Efficience des Soins : Contrat unique regroupant l'ensemble des contrats existants entre les établissements de santé, l'ARS et l'assurance maladie :
- Contrat de Bon Usage (CBU)
- Contrat pour l'Amélioration de la Qualité et l'Organisation des Soins (CAQOS)

- Contrat de Pertinence des Soins (PAPRAS)
- Contrat d'Amélioration des Pratiques en Etablissements de Santé (CAPES)
Il est composé d'un volet obligatoire relatif au bon usage des médicaments, des produits et prestations, appelé "contrat socle" et de volets additionnels

CASD

Centre d‘Accès Sécurisé aux Données

CEREES

Comité d'Expertise pour les Recherches, les Etudes et les Evaluations dans le domaine de la Santé : comité émettant un avis à la CNIL pour l’autorisation des études et évaluations et les recherches n'impliquant pas la personne humaine (méthodologie retenue, nécessité et pertinence du recours à des données à caractère personnel, qualité scientifique du projet, etc.)

CERES

Comité d'Ethique pour les Recherches en Santé

CGTS

Centre de Gestion des Terminologies de Santé : guichet unique de publication et chargement des terminologies, des jeux de valeurs et alignements (porté par l’ASIP Santé)

CIL

Correspondant Informatique et Libertés mutualisé des établissements de santé : mission d'accompagner les établissements de santé afin d'assurer leur conformité avec la Loi Informatiques et Libertés

CNAV

Caisse Nationale d‘Assurance Vieillesse

ConSoRe

Continuum Soins-Recherche : moteur de recherche pour le big data en cancérologie

CPU

Central Processing Unit : Processeur Central d'un ordinateur

CRAM

Caisse Régionale d'Assurance Maladie

CREDIM

Centre de Ressource et Développement en Informatique Médicale : créé au sein de l'Université de Bordeaux en juillet 2000 pour les aspects scientifiques de traitement des données médicales, essentiellement en santé publique, dont la vocation est prioritairement tournée vers les équipes de recherche

CRIANN

Centre Régional Informatique et d’Applications Numériques de Normandie

CROM

Clinician Related Outcome Measures

DINSIC

Direction Interministérielle des Systèmes d'Information et de Communication de l'Etat

DPI

Dossier Patient Informatisé

DPO

Data Protection Officer : Délégué pour la Protection des Données

DRC

Dictionnaire des Résultats de Consultation

EAI

Intégration d’Applications d’Entreprise : architecture intergicielle permettant à différentes applications d’échanger en quasi-temps-réel

EHR4CR

Electronic Health Records for Clinical Research : Système interoperable connecté aux hôpitaux

FHIR

Fast Healthcare Interoperability Resources : Standard de description des formats de données, des éléments (ressources) et de l’API pour l’échange de données électroniques de santé – Nouvelle generation de HL7

FLI

France Life Imaging : mission de coordonner et d’harmoniser le réseaux des ressources en imagerie in-vivo en France

FMG

France Médecine Génomique

FNORS

Fédération Nationale des Observatoires Régionaux de Santé (ORS)

FSM

Fédération des Spécialités Médicales

FTAP

Fonds de transformation pour l'action publique

GENES

Groupe des Ecoles Nationales d'Economie et de Statistique qui a initié le CASD (Centre d'Accès Sécurisé aux Données) en partenariat avec l'INSEE

GPU

Graphic Processing Unit : Processeur qui équipe la Carte Graphique

HL7

Health Level-7 : ensemble de normes internationales pour le transfert de données cliniques et administratives entre applications logicielles. HL7 est une organisation à but non lucratif impliquée dans le développement de normes internationales d'interopérabilité de l'informatique de santé

HPO

Human Phenotype Ontology : développé par The Monarch Initiative, elle-même développée par le NIH en partenariat avec un consortium dédié à l'intégration sémantique des données biomédicales et organiques en vue d'améliorer la recherche biomédicale

IDEX

Initiatives d'Excellence : label décerné dans le cadre du Programme d'Investissement d'Avenir (PIA) pour les universités de rang

Inria

Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique

Instituts 3IA

Institut Interdisciplinaire d'Intelligence Artificielle : projet dédié à l'Intelligence Artificielle mené par l'Université Fédérale de Toulouse

IRB

Institutional Review Board

MESRI

Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche

NSQL

A NoSQL (originally referring to "non SQL" or "non relational") database provides a mechanism for storage and retrieval of data that is modeled in means other than the tabular relations used in relational databases

PEPS

Plateforme d’Exploitation des Produits Sentinels (données océanographie, atmosphère, hydrologie, etc.)

PIA

Programme d'Investissement d'Avenir : programme doté de près de 57 Mds €, piloté par le commissariat général à l'Investissement, mis en place par l'État pour financer des investissements innovants et prometteurs sur le territoire, avec un principe de co-financement pour chaque projet

PREM

Patient Rated Experience Measure

Projet INSHARE

Integrating and Sharing Health Data for Research

PROM

Patient-Reported Outcome Measures

REDSIAM

Réseau pour l'utilisation des données du système national des Données de Santé : mission de mise au point et de diffusion d'algorithmes destinés à repérer des cas de pathologies à partir des données enregistrées par le SNDS

RGCPC

Registre général des cancers de Poitou-Charentes

ROSP

Rémunération sur Objectifs de Santé Publique : Qualité de la pratique clinique des médecins dans la convention médicale du 25 août 2016

RSDS

Référentiel de Sécurité des Données de Santé

SGPI

Secrétariat Général pour l'Inverstissement - Suivi du Grand plan d'investissement et de la mise en œuvre du PIA

SHRINE

Shared Health Research Information Network - Open source scalable informatics framework, which enables a common platform and clinical data model at each institution to be networked across the web

SIGAPS

Système d'Interrogation, de Gestion et d'Analyse des Publications Scientifiques : projet initié au CHRU de Lille et financé par la DGOS, dédié au recensement, à l'évaluation et la valorisation des publications scientifiques des établissements de recherche médicale

SOAP

Simple Object Access Protocol : protocole d'appels de procédures sur un ordinateur distant. Il permet la transmission de messages entre objets distants, ce qui veut dire qu'il autorise un objet à invoquer des méthodes d'objets physiquement situés sur un autre serveur

SQL

Structured Query Language : langage standard pour l’accès et la manipulation de bases de données

TALN

Traitement Automatique du Langage Naturel

UMR

Unité Mixte de Recherche : entité administrative créé par l'association de plusieurs laboratoires de recherches avec le CNRS

ARC

Fondation ARC pour la recherche sur le Cancer

CDR2 / R3

Formats de fichiers

Deep learning

Machine learning basé sur le représentation des données (vs. des algorithmes effectuant des taches spécifiques)

DXCARE

Solution développée par MEDASYS d'aide à la prise en charge des patients

eHOP

Mission de traiter et exploiter les gisements de données patients afin de faciliter la recherche médicale dans des conditions de sécurité optimales et en respectant les règles éthiques, juridiques et déontologiques / 6 CHU du Grand Ouest avec des plateformes communes

Essais pragmatiques

Evaluer « l'intérêt » d'un traitement ou d'une stratégie thérapeutique dans des conditions réelles de prescription

Francim

Réseau Français des Registres de Cancer né du regroupement des registres du Comité d'Evaluation des Registres (anciennement Comité National des Registres) qui a pour objectif d’harmoniser les pratiques d’enregistrement, de coordonner et de faciliter les travaux réalisés par les registres de cancer existants, de fournir à la communauté les indicateurs épidémiologiques utiles à la connaissance et à la prise en charge des cancers en lien avec différents partenaires institutionnels

GITHUB

Entreprise spécialisée dans les logiciels dont notamment la plateforme Github pour les entreprises

Hadoop

Outil open source permettant le traitement de larges quantités de données via des modèles de programmation simples basés sur un cluster d'ordinateurs

Heroku

Service de cloud computing de type plateforme en tant que service, qui appartient à Salesfoce

HEVA

Start-up spécialisée sur le traitement des données de santé et la data visualization

Hu-PreciMED

Projet de structuration de la filière de médecine de précision en France

i2B2

Open-source / open-data community around the i2b2, tranSMART and OpenBEL translational research platforms

Kubernetes

Technologie de déploiement de contener / dockers opensource et gratuit

Medifirst

Entrprise qui développe des solutions informatiques de contrôle qualité pour les centres de procréation assistée, des centres de génétique et des réseaux de recherche ou des associations savantes de médecins

Ontologie

L'ontologie s'intéresse à l'apparition des entités médicales : maladies, signes et syndromes cliniques, lésion, syndromes lésionnels, etc.

Opt-in / opt-out

Système opt-in suppose obtenir l'accord du destinataire, le sytème Opt-out est la non opposition du destinataire

OSIRIS

GrOupe inter-SIRIC sur le paRtage et l’Intégration des donnéeS clinico-biologiques en cancérologie / liste de 130 items cliniques et omiques, le « Set OSIRIS », constituant un jeu de données minimales pour le partage de données clinico-biologiques

OVH

Entreprise spécialisée dans les solutions clouds, database, web hosting

Python

Langage de programmation populatire pour les statististiques

R

Langage de programmation populatire pour les statististiques

Réseau OSCOUR

Informations anonymisées, issues du dossier médical informatisé du patient constitué lors de son passage aux urgences

Sentinel

Les indicateurs Sentinel permettent de signaler les changements dans un système dans lequel un projet opère, alertant les porteurs de projet sur le besoin de déterminer l'origine du changement et de l'analyser

Solr

Apache Solr est une plateforme open source de recherche de données stockées sur HDFS (Hadoop Distributed Files System)

Spark

Framework open source de calcul distribué développé par Apache